بالا بودن سرانه تولید زباله، نبود کارخانه پسماند در حال فعالیت، اصولی نبودن دفن زباله در برخی سایت‌ها و حصار نشدن تقریباً تمام جایگاه‌های جمع‌آوری از چالش‌های مدیریت پسماند در کهگیلویه و بویراحمد محسوب می‌شود.